Arrivé en 2012 après des essais concluants, Joel Pereira a fait toutes ses classes à l’Académie du club. C’est en 2017 qu’il est lancé dans le grand bain par José Mourinho qui voyait en lui les capacités à devenir le futur gardien numéro 1 du Portugal. Cependant, la carrière professionnelle du Suisse d’origine portugaise va vite tourner court avec les Red Devils. Monté au jeu lors d’une victoire 4-0 face à Wigan, il n’aura droit qu’à deux autres occassions pour s’exprimer. Ayant que très peu de temps de jeu, il connaît divers prêts à l’étranger mais sans jamais convaincre, jusqu’à même décevoir…

À son retour dans l’équipe en 2021, le club lui a fait comprendre qu’il n’avait plus aucun avenir du côté de Manchester. Il partira gratuitement en juin 2021 à la fin de son contrat et rejoindra le RKC Walwijk au Pays-Bas.