Samuel Lynn est arrivé depuis St Helens pour rejoindre l’Academy du club. En 1938 il signe son premier contrat professionnel mais le déclenchement de la Seconde guerre mondiale retarde ses débuts avec le club. Il doit donc attendre jusqu’à janvier 1948 pour effectuer ses premiers pas avec Manchester United lors d’une victoire à Charlton Athletic. Il avait alors déjà 27 ans.

Étant peu utilisé par Matt Busby, il doit se contenter d’évoluer principalement avec l’équipe réserve. À cause de son temps de jeu limité, il rejoint finalement Bradford en février 1951.